Há agora evidências de que os Balcãs e as outras penínsulas europeias representam os mais importantes grupos genéticos de espécies de caça, como o javali (Sus scrofa). Os javalis capturados ou caçados nos Balcãs são comercializados em toda a Europa como animais vivos ou carne. A gestão dos recursos genéticos desta espécie necessita de uma descrição detalhada da variabilidade representada por diferentes populações e da integração destes dados com a sua dinâmica para uma exploração e sustentabilidade económica frutífera. Além disso, a caracterização genética de diferentes populações de javalis e de suínos domésticos na Europa pode fornecer dados úteis para a monitorização, identificação e rastreabilidade de animais ou carne, o que a torna relevante no contexto forense. Um problema particular relacionado ao javali é a necessidade de evitar ou monitorizar a introgressão genética de porcos domésticos. Isso é importante, pois javalis selvagens podem cruzar com porcos domésticos produzindo híbridos férteis, o que apresenta riscos económicos e ecológicos.