A remediação de zonas húmidas, com o intuito de melhorar a qualidade da água e do ambiente, constitui uma das prioridades europeias no âmbito da directiva quadro da água (DQA). O mercúrio (Hg) constitui um dos contaminantes de maior perigosidade presente nos sistemas aquáticos, sendo amplamente reconhecido como um dos poluentes ambientais prioritário. O conhecimento dos processos, subjacente à recuperação se sistemas estuarinos com contaminação crónica por mercúrio, assim como a previsão da distribuição dos contaminantes no ambiente e do seu grau de impacto, está intimamente dependente da exacta estimativa das taxas de transformação entre as diferentes formas poluentes de mercúrio, da informação quantitativa da sua partição nas diferentes formas, e da caracterização dos processos bióticos e abióticos que poderão influenciar a sua bio-disponibilidade e mobilização. Este projecto tem por objectivo contribuir para a implementação da Directiva quadro da Água (DQA), produzindo uma ferramenta de gestão que permitirá aos gestores ambientais tomar decisões no sentido de melhorar o estado ecológico de estuários contaminados com mercúrio.