O objetivo do projeto Nymphe é desenvolver estratégias de biorremediação/revitalização com base na combinação de sistemas biológicos (enzimas, microrganismos, bivalves, minhocas e plantas) desenvolvidas e aplicadas em matrizes de diferentes matrizes contaminadas: águas subterrâneas, sedimentos (zona hiporreica), águas residuais, bem como solos industriais e agrícolas. A combinação de sistemas biológicos é guiada pelo uso de modelos preditivos de interação microbiana no microbioma da matriz real a ser descontaminada. Os melhores sistemas de biológicos são reintroduzidos nos locais contaminados (4 locais mais 1 para testes confinados usando sistemas biológicos desenvolvidos com recurso à edição genómica). O Nymphe visa remover pelo menos 90% dos poluentes presentes nos locais, como plásticos e pesticidas no solo agrícola, e solventes clorados/hidrocarbonetos de petróleo em águas subterrâneas e sedimentos do local industrial. Além disso, os sistemas biológicos beneficiam do desenvolvimento tecnológico de plataforma para: garantir consórcios estáveis (adesina+auxotrofias complementares), acelerar a evolução dos microrganismos, aumentar a mobilidade de plasmídeos degradativos, editar genomicamente bactérias para produzir enzimas evoluídas, produzir sistemas enzimáticos com reciclagem de cofatores, controlar a distribuição espacial de biodegradadores (impressão 3D), protegê-los em ambientes adversos, facilitar processos redox por eletromicrobiologia, projetar biocatalisadores redox auto-sustentáveis. As estratégias de biorremediação/revitalização passam por uma avaliação completa: análises de risco ecológico e ambiental (análises químicas, ecotoxicológicas e de apoio, por exemplo, função e biodiversidade dos microbiomas), análise de risco tecnológico, avaliação do ciclo de vida, custo do ciclo de vida, análise de eficiência de custos, análise de biossegurança e restrições regulatórias, e análise societal, para finalmente serem comparadas com as soluções atuais. O estado ecológico dos locais biorremediados deverá estar mais próximo das especificações da rede Natura 2000.
