De acordo com a Directiva Quadro da Água (DQA), a utilização específica dos portos tem sido reconhecida como de elevado valor económico e social. Por isso, essas massas de água são classificados como massas de água fortemente modificadas. Este reconhecimento justifica a redução dos seus objectivos ambientais até um bom potencial ecológico, e obriga a um sistema de gestão específico. Neste contexto, este projecto pretende
desenvolver e obter resultados científicos de qualidade elevada, procurando que esses resultados estejam de acordo com a directiva europeia sobre a qualidade de água em portos. Concretamente, o projecto PORTONOVO pretende padronizar metodologias para a gestão da qualidade de água em áreas portuárias na área Atlântica.