Este curso será realizado na Universidade de Aveiro, de 8 a 11 de julho. O objetivo deste curso de verão é fornecer as competências práticas para realizar a análise integrativa de dados RNA-seq e ChIP-seq. Um estudo de caso sobre o papel das modificações das histonas na regulação da expressão genética em resposta à temperatura no fitoplâncton marinho será utilizado para introduzir os diferentes aspetos teóricos e ferramentas de software.

Destinado a: Estudantes de doutoramento, pós-doutorados, investigadores e pessoal técnico.

Programa:

• Unidade 1: Introdução ao R e UNIX: Rstudio e MobaXterm. Introdução à sequenciação de alta performance: dados RNA-seq e ChIP-seq.
• Unidade 2: Análise de dados RNA-seq. Controlo de Qualidade. Mapeamento de leituras. Normalização de Dados e Análise Exploratória. Análise diferencial de expressão genética. Análise de Enriquecimento Funcional.
• Unidade 3: Análise de dados ChIP-seq. Controlo de qualidade. Mapeamento de leituras. Calling e anotação de picos. Normalização de Dados e Análise Exploratória. Análise diferencial de modificações de histonas.
• Unidade 4: Análise Integrativa. Associação entre modificações de histonas e expressão genética. Redes de Co-expressão Genética Ponderadas. Redes Regulatórias Transcricionais.

Duração: 20 horas

09:00 – 10:30: Primeiro Período
10:30 – 11:00: Pausa para Café
11:00 – 12:30: Segundo Período
12:30 – 14:00: Pausa para Almoço
14:00 – 16:00: Terceiro Período

Número de formandos: 20 (10 grupos de duas pessoas)

Registe-se aqui.