Os sistemas aquáticos temporários são frequentes na região Mediterrânica assim como em regiões semi-aridas. São definidos como sistemas que pelo menos durante um determinado período do ano não apresentam caudal superficial (Verão nas regiões mediterrânicas). Relativamente à estrutura e ao funcionamento destes sistemas, é obvio que tanto as comunidades terrestres como as aquáticas estão sujeitas a regimes hidrológicos extremos, onde as condições abióticas interagem em diferentes escalas. Estudos antecedentes têm-se debruçado sobre as complexas interacções entre a hidrologia, os processos ecológicos e a biodiversidade, conhecendo-se com algum detalhe o impacte das enxurradas no ecossistema aquático. Todavia, não existe informação relativa à importância ecológica e à contribuição dos nutrientes contidos na matéria vegetal, especialmente na biomassa aérea de macrófitos arrastados pela força da corrente durante as enxurradas, não se sabendo qual o efectivo contributo para o enriquecimento em nutrientes das albufeiras localizadas a jusante. Complementarmente, o padrão de quedas das folhas não está descrito para sistemas sujeitos a um tão grande stress hidrológico durante o período seco de Verão, não se sabendo qual a contribuição da matéria orgânica e consequentemente dos nutrientes neste cenário. Grande parte dos modelos de bacia e de qualidade da água, têm sido desenvolvidos e aplicados em climas húmidos, tendo atingido o estatuto de ferramentas fundamentais na gestão e planeamento ambiental. Todavia, em climas semi-áridos a aplicação de modelos de bacia é limitado. Nestas situações é fundamental incluir as condições específicas de seca estival. A compreensão e a previsão das complexas interacções entre a hidrologia e a dinâmica do sistema constituem a base dos requisitos da Directiva Quadro da Água. Contudo, a Directiva Europeia Quadro da Água não considera os sistemas temporários, apesar da sua importância na região Mediterrânica. A proposta apresentada pretende contribuir especificamente nesta área, através da experiência, resultados e conhecimento adquiridos numa bacia piloto temporária, localizada no sul de Portugal (bacia da Pardiela pertencente à bacia do rio Guadiana), para a qual será considerada toda a informação disponível dos últimos 50/70 anos. Pretende-se ainda propor estratégias de conservação e reabilitação que auxiliaram os parceiros aplicados (entidades com responsabilidade na gestão) através do fornecimento de ferramentas para uma gestão sustentável.