O presente projecto tem como objectivos determinar o perfil das comunidades microbiológicas associadas a peixes [dourada (Sparus aurata) e robalo (Dicentrarchus labrax)] e bivalves [ostra (Ostrea edulis), berbigão (Cerastoderma edule), ameijoa boa (Ruditapes decussata) e ameijoa macha (Venerupis pullastra)] produzidos na Ria de Aveiro e compará-los com os de organismos selvagens e de organismos produzidos noutras regiões geográficas através da utilização de ferramentas moleculares. Pretende-se com esta metodologia desenvolver protocolos de rastreabilidade eficientes para os organismos produzidos, sendo a validação desta metodologia o primeiro passo para a obtenção de certificados de origem para produtos de origem marinha.